结核分枝杆菌
全基因组序列分析平台 v2.0

⋅ 平台功能 ⋅

流程自动化

可以自动化完成包括数据过滤、比对、注释等步骤在内的结核分枝杆菌单核甘酸多态性(SNP)分析,界面友好,操作简单。

菌株耐药和敏感性预测

可预测14种常用抗结核药物的耐药性和4种常用一线抗结核药物的敏感性,为临床用药提供参考。

菌株遗传距离分析

比较不同菌株间遗传距离,可用于鉴定结核病近期传播或暴发事件,为流行病学调查和结核病防控提供理论指导。

系统功能丰富

除可完成耐药突变鉴定、菌株敏感性预测、菌株亚型判定、进化树构建以及菌株间遗传距离等分析外,系统还同时具有数据储存和样本信息管理

规范化信息管理

本系统分析步骤流程化,分析结果标准化,数据信息规范化;用户可以按分析、样本等不同维度,方便快捷的进行数据管理操作。

安全可靠

数据高度安全,每个用户拥有自己的独立账户,系统精细控制每个用户的权限。

⋅ 文献引用 ⋅

1. Yang T, Gan M, Liu Q, et al. SAM-TB: a whole genome sequencing data analysis website for detection of Mycobacterium tuberculosis drug resistance and transmission. Brief Bioinform. 2022;23(2):bbac030. doi:10.1093/bib/bbac030

⋅ 合作单位 ⋅

深圳市慢性病防治中心

复旦大学

中国防痨协会

深圳联合医学科技有限公司

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